Metsän Suojelusäätiön tavoitteena on pysyvästi suojella monimuotoisuudeltaan arvokkaat kohteet siten, että kohteen omistus säilyy suojelua hakeneella metsänomistajalla. Tällöin metsänomistajan kiinteistölle perustetaan yksityinen suojelualue (YSA) Elinvoimakeskuksen päätöksellä.
Säätiö vastaanottaa suojeluhakemuksia säännöllisesti erikseen määriteltyinä hakuaikoina. Mikäli omistat monimuotoisuudeltaan arvokkaan metsäkohteen, jonka haluat pysyvään suojeluun, täytä ja lähetä suojeluhakemuslomake, silloin, kun säätiöllä on hakuaika käynnissä. Vuonna 2026 hakuaika on 5.3.-30.4. Metsän Suojelusäätiö suojelee sääntöjensä mukaisesti yksityisen sektorin metsänomistajien metsiä.
Metsän Suojelusäätiö maksaa metsänomistajalle kertaluonteisen suojelukorvauksen onnistuneesta suojelusta. Suojelukorvaus mukailee julkisen METSO-ohjelman suojelukorvausta puustoisilla alueilla, jolloin suojelukorvaus perustuu puuston arvoon.
